Joe Higan é um Nukenin – um ex-ninja que escapou de seu clã e está se escondendo de seu passado violento na América rural com sua família. Uma noite, ele é emboscado por uma equipe de assassinos de sua antiga organização que exigem uma retribuição sangrenta contra Joe e sua família por trair seu antigo código. Ressuscitando de sua aparente "morte", Joe ressurgirá como seu antigo eu – Ninja Kamui – para vingar sua família e amigos. Kamui é um ninja do século 21, um anacronismo sombrio que coloca suas habilidades antigas contra armamentos de alta tecnologia com uma refinaria brutal. Ele deve enfrentar assassinos treinados, ciborgues de combate e ninjas rivais para derrubar o próprio clã que o criou.
